纤维肠镜比纤维胃镜要晚数年才应用于临床，常用的有68厘米长的纤维乙状结肠镜和140厘米或170厘米长的纤维全结肠镜两种，主要用于大肠的检查，全结肠镜亦可进行部分回肠检查。
1)肠穿孔、弥漫性腹膜炎，或肠广泛粘连者 2)细菌性痢疾活动期 3)直肠、肛管、肛周有急性炎症者 4)严重的心、肺、脑疾病，或身体极度衰竭者
小肠肿瘤,胰腺炎,阑尾腺癌,小肠血管瘤,肠道息肉病,肠道血管畸形,结肠黑变病,短肠综合征,小儿消化道出血,急性出血性坏死性肠炎,肠气肿综合征
腹胀,下腹胀痛,肠穿孔,肠出血,上腹部肿块及腹胀,术后腹胀,便下恶臭,肠鸣漉漉,腹痛下痢,肠痉挛
其他人群： 1)肠穿孔、弥漫性腹膜炎，或肠广泛粘连者 2)细菌性痢疾活动期 3)直肠、肛管、肛周有急性炎症者 4)严重的心、肺、脑疾病，或身体极度衰竭者
不合宜人群： 1)肠穿孔、弥漫性腹膜炎，或肠广泛粘连者。 2)细菌性痢疾活动期。 3)直肠、肛管、肛周有急性炎症者。 4)严重的心、肺、脑疾病，或身体极度衰竭者。 检查前禁忌：进食。 检查时要求：检查者要认真检查。
正常： 腹部没有肿块，结肠方面没有病变，也没有出现原因不明的出血。 异常： 异常结果：1)肠穿孔; 2)肠出血; 3)腹胀; 4)肠管撕裂伤; 5)偶有心血管意外。 导致该异常结果可能疾病为： 小肠肿瘤 胰腺炎 阑尾腺癌 小肠血管瘤
检查当日进无渣流质饮食或禁食，检查前2小时清洁洗肠，检查前半小时，安静休息。检查时，病人先取左侧卧位，腹部放松，并曲膝。检查中按医生的要求更换体位。检查中如有疼痛，立即向医生诉说，便于医生安全插镜。
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