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目前应用于遗传性耳聋的常规基因检测手段有哪些

发布日期:2014-11-29 02:17:41 浏览次数:1600

直接测序(direct sequencing,DS)是将聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增产物纯化、变性后,在测序仪上进行测序,为寻找突变的金标准。但其仪器设备昂贵,且操作复杂、耗时较长。此外,杂合突变、胶压缩、GC富集区的存在等问题使得很难通过一次测序获得精确的数据。

2限制酶切指纹-单链构象多态性分析:限制性核酸内切酶切割目标基因的PCR扩增产物,琼脂糖凝胶电泳检测梅切产物,根据异常构象带进行目标基因有无突变的判断。该方法最主要的问题是不能检测到所有的突变,由各实验室报道的突变检出率冲99%到35%不等。同时该方法要求多次摸索条件,如电泳温度,胶中甘油浓度以及胶联度等均可影响检测的灵敏度。此外,该方法也不能确定突变的精确位置。

3 限制性片段长度多态性分析:是用特定的限制性内切酶水解目标基因的PCR扩增产物,然后分析酶解产物的电泳图谱特征,根据与正常对照的比对结果来判断待检样品是否存在某个基因突变,其弱点操作繁琐,检出率低,因为并非所有的基因突变都恰好位于某个内切酶的识别区。

4 变性高效液相色谱分析: 此技术是一项在单链构象多态性分析和变性梯度凝胶电泳基础上发展起来的新的杂合双链突变检测技术。它能对大批量PCR扩增产物进行筛查,其在检测大量致病基因的不同序列方面显示出高度的敏感性,适合做快速的基因筛查。目前该技术主要用来检测200~300bp大小的DNA片段,长的DNA片段的检测尚未见报道。

基因芯片是指将许多特定的寡核苷酸片段或基因片段作为探针,有规律地排列固定于支持物上,然后与待测的标记样品的基因按碱基配对原理进行杂交,再通过激光共聚焦荧光检测系统等对芯片进行扫描,并配以计算机系统对每一探针上的荧光信号作出比较和检测,从而迅速得出所要的信息。基因芯片技术因其具有微型化、集约化和标准化的特点,在感染性疾病、遗传性疾病、重症传染病和恶性肿瘤等疾病的临床诊断方面具有独特的优势,可将对应于突变热点的寡核苷酸探针合成点或点加于DNA芯片上,通过一次杂交完成对待测样品多种突变可能性的筛查,实现对疾病的高效快速诊断。

基因检测芯片技术具有高效率、高通量等特点,由博奥生物和301医院联合推出的耳聋检测基因芯片已经在国内率先取得国家食品药品监督管理局医疗器械证书,将有助于改变我国许多地区遗传性耳聋缺乏早期诊断的状况。可以提供从孕前、产前到出生的基因检测,帮助生育父母及时获知新生命的遗传信息并采取措施,降低新生儿患遗传性耳聋的概率。

6第六种耳聋基因检测方法——飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)

质谱方法检测基因是首先进行PCR扩增目的片断区域,然后加入多对特异性引物,进行单碱基延伸,再将单碱基延伸产物纯化后打质谱,根据不同引物扩增产物的质荷比不同,判断有无碱基突变。

详见:http://blog.sciencenet.cn/blog-623020-483407.html

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